长期从事煤矿工作肺部出问题，应申请工伤认定并寻求赔偿。根据《工伤保险条例》等法律，煤矿工伤需先认定工伤，再鉴定劳动能力，最后确定赔偿。不及时处理可能导致合法权益无法保障，甚至健康进一步受损。
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煤矿工伤需处理。具体操作：1.立即申请工伤认定，保留相关医疗证明；2.申请劳动能力鉴定，明确伤残等级；3.与单位协商赔偿，不成则申请劳动仲裁；4.必要时，可诉诸法院，确保权益得到维护。
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处理煤矿工伤的常见方式有协商和劳动仲裁两种。应先与用人单位协商赔偿，协商不成时再向劳动仲裁机构申请仲裁，以法律途径维护自身权益。