农村合作医疗交两份通常可以退一份。分析：农村合作医疗是社会保障体系的一部分，旨在为农村居民提供医疗保障。按照相关法律规定，个人不得重复参加同一类型的医疗保险。如果已交了两份农村合作医疗，可以向相关部门申请退掉其中一份。这涉及到保险合同的解除和退费流程，需遵循具体规定办理。提醒：若申请退费过程中遇到阻碍，或发现费用未能及时退还，可能表明问题比较严重，应及时寻求专业人士的帮助。
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处理方式：从法律角度看，处理农村合作医疗交两份的问题，常见方式有：1. 向当地农村合作医疗管理部门咨询退费政策和流程。2. 准备相关证明材料，如身份证、缴费凭证等，向管理部门提交退费申请。3. 根据管理部门的要求，配合完成退费手续。选择处理方式时，应优先考虑官方渠道，确保信息的准确性和流程的合规性。
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具体操作：从法律角度，针对农村合作医疗交两份的问题，在不同情况下的处理方式如下：1. 若两份保险均在同一地区缴纳，可直接向当地农村合作医疗管理部门申请退掉其中一份，并提供相关证明材料。2. 若两份保险分别在不同地区缴纳，需先向两地管理部门咨询退费政策，然后按照要求分别提交退费申请。3. 在退费过程中，如遇到管理部门拒绝退费或拖延退费时间等问题，可向上级管理部门或相关部门进行投诉，并保留好相关证据以备后续处理。同时，也可考虑寻求法律援助或咨询专业律师以维护自身权益。以上操作均需在遵守相关法律法规的前提下进行。