每月扣绩效工资是否合法需具体情况分析。依据《劳动法》，公司不得非法克扣工资，随意扣绩效属违法行为。长期随意克扣会影响员工权益，造成劳动纠纷。
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扣绩效工资需慎重。操作方式：1. 核查扣除依据，确保合法合规；2. 与员工沟通，解释扣除原因；3. 如员工有异议，提供申诉渠道；4. 违规扣除时，需及时纠正并补偿。
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处理公司扣绩效工资问题，可协商、投诉或仲裁。建议先与公司沟通，若协商无果则向劳动监察部门投诉，必要时可申请劳动仲裁。